Além da Coordenação Geral, o INCT Caleidoscópio é liderado por uma Comissão Gestora que, junto à primeira, organiza as atividades do instituto, tais como reuniões gerais e setoriais, elaboração de editais, planejamento de custo etc. Fazem parte deste Comitê Gestor as seguintes mulheres:
- Dolores Cristina Gomes Galindo - Universidade Federal de Mato Grosso/UFMT
- Joana Maria Pedro - Universidade Federal de Santa Catarina/UFSC
- Maria Carmen Aires Gomes - Universidade de Brasília/UnB
- Maria Margaret Lopes - Universidade Estadual de Campinas/UNICAMP
- Silvia Lúcia Ferreira - Universidade Federal da Bahia/UFBA